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爲了增進液體活檢研討的數據剖析,QIAGEN公司近日推出了RNA-seq Explorer Solution。這是一種新的對象,整合了Ingenuity® Pathway Analysis™、Biomedical Genomics Workbench®及其他QIAGEN生物信息學計劃,有助于改良癌症的檢測、診斷和醫治。
或許你正在用Apple Pay,然則你也許還不曉得,液體活檢(Liquid biopsy)與Apple Pay一樣是2015年度的十大沖破技術。這是一種非侵入性的辦法,可以應用體液(如血液),在癌症等疾病的晚期檢測和剖析疾病,帶來更好的預後和醫治。
爲了增進液體活檢研討的數據剖析,QIAGEN公司近日推出了RNA-seq Explorer Solution。這是一種新的對象,整合了Ingenuity® Pathway Analysis™、Biomedical Genomics Workbench®及其他QIAGEN生物信息學計劃,有助于改良癌症的檢測、診斷和醫治。
RNA-seq Explorer Solution增進了生物標記物的發明和驗證,讓研討人員能從FASTQ格局的原始數據中取得主要線索,從而追蹤癌症的遺傳驅動身分。這個計劃應用Ingenuity Pathway Analysis(IPA),基于後台高度構造化的Ingenuity Knowledge Base完成表達數據的剖析、整合和懂得。它還整合了Biomedical Genomics Workbench,爲NGS試驗成果的比對、尺度化和統計剖析供給了周全的剖析流程。
“RNA-seq Explorer Solution帶來了壯大的生物信息學對象,實用于液體活檢樣本RNA測序數據的剖析息爭釋,包含腫瘤起源的exosomes。液體活檢的新一代測序是檢測和判定癌症最有前程的方法之一,然則須要高度精確的對象來懂得帶有樂音的數據,”QIAGEN生物信息學部分的高等副總裁Laura Furmanski談道。
液體活檢的剖析對象有好幾種,包含輪回腫瘤細胞(CTCs),從腫瘤上零落的活細胞;輪回腫瘤DNA(ctDNA),來自逝世細胞的遺傳物資;和外泌體(exosomes),在體液中輪回的微囊泡。
關於這些樣本的剖析,QIAGEN都供給了響應的産品。例如,QIAamp Circulating Nucleic Acid Kit可從人類血漿或血清中稀釋和純化遊離DNA和RNA,用于特異性的腫瘤檢測。同時,QIAGEN的單細胞全基因組/全轉錄組擴增計劃可以讓你輕松跨過樣本量低的限制,幫你深度解析CTCs內隱蔽的信息。
另外,QIAGEN也推出了一種基于離心柱的輕便辦法來分別細胞外囊泡,並提掏出個中的RNA。有了exoEasy Maxi Kit,25分鍾便可完成exosomes的分別。exoRNeasy Midi和Maxi試劑盒在此基本上,分別出樣本中的RNA,用于後續的RNA-Seq剖析